RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TNS2Q63HR2 1409 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 RGPD5Q99666 1765 aa6.56□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 A0A087WZG4 1122 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SH3D21A4FU49 640 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 NCAM1P13591 858 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SPATS1Q496A3 300 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ALG3Q92685 438 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 AKT3Q9Y243 479 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 COL15A1P39059 1388 aa6.55□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 AURKAO14965 403 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ERC2O15083 957 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TOM1O60784 492 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 PMLP29590 882 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 DDIT3P35638 169 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 FERMT3Q86UX7 667 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 BVESQ8NE79 360 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 RILPL2Q969X0 211 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 EPN3Q9H201 632 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 GLI3P10071 1580 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 STXBP3O00186 592 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 AGRPO00253 132 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ITGAVP06756 1048 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TCIRG1Q13488 830 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 CASC1Q6TDU7 716 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 LILRB2Q8N423 598 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 IL17RAQ96F46 866 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 NOX5Q96PH1 765 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 IL25Q9H293 177 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 USP40Q9NVE5 1235 aa6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 BCL9O00512 1426 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PQU0 124 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 TBX1O43435 398 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 KCNH1O95259 989 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 RABEP1Q15276 862 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 HLFQ16534 295 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 AACSQ86V21 672 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 HSCBQ8IWL3 235 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.52□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 SGSM2O43147 1006 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 REC8O95072 547 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 STARD3NLO95772 234 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 TFCP2Q12800 502 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 DDB1Q16531 1140 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 UBXN11Q5T124 520 aa6.51□□□□□ -1.37
TRDN-205ENST00000546248 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.51□□□□□ -1.37
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