RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TXKP42681 527 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB27AP51159 221 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PDIA5Q14554 519 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LPIN1Q14693 890 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MTERF2Q49AM1 385 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MCTP1Q6DN14 999 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TPH2Q8IWU9 490 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 AIFM3Q96NN9 605 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NACC1Q96RE7 527 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LXNQ9BS40 222 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PADI3Q9ULW8 664 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NR1I2O75469 434 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT37O76014 449 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ERLIN2O94905 339 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPLA2O95372 231 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC24BO95487 1268 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 OR52Z1P0C646 297 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ALADP13716 330 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 AXLP30530 894 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM7P33993 719 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1AP35813 382 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PHKA2P46019 1235 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-21P61565 698 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB103AP81534 67 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TAP1Q03518 808 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT17Q04695 432 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 POU5F1BQ06416 359 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAT3Q09327 533 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NR5A1Q13285 461 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KIZQ2M2Z5 673 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 XKR9Q5GH70 373 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC38Q5R3I4 469 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT79Q5XKE5 535 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BRAPQ7Z569 592 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM192Q8IY95 271 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 BANK1Q8NDB2 785 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CNNM3Q8NE01 707 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 PGBD4Q96DM1 585 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 OSMRQ99650 979 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 MTRQ99707 1265 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM2Q99965 735 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 TECTAO75443 2155 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC01553A4QN01 128 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A4O43511 780 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC37A4O43826 429 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 GFRA3O60609 400 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 JAK2O60674 1132 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-215ENST00000544584 VTNP04004 478 aa6.24□□□□□ -1.41
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