RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543118.1

RFXANK-211, Transcript of regulatory factor X associated ankyrin containing protein, human

TSL 2

Gene RFXANK, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFXANK-211	ENST00000543118	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	IL9	P15248	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PRCP	P42785	496 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	BFSP2	Q13515	415 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	HYI	Q5T013	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	SPRED2	Q7Z698	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	INTS13	Q9NVM9	706 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	NOD1	Q9Y239	953 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KLRC4	O43908	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	MYL3	P08590	195 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CCDC175	P0C221	793 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FDX1	P10109	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CPT1A	P50416	773 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	UNC13D	Q70J99	1090 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	MBOAT7	Q96N66	472 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	RNF146	Q9NTX7	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	EXOC1	Q9NV70	894 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KCNJ18	B7U540	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TUBB	P07437	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TEC	P42680	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	STAT2	P52630	851 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KRT31	Q15323	416 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	P2RX5	Q93086	422 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	MARCH6	O60337	910 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	GNA14	O95837	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	ALAS1	P13196	640 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	PLCG1	P19174	1290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	MUT	P22033	750 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CDK17	Q00537	523 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RFXANK-211	ENST00000543118	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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