RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 ERVK-21P61565 698 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 RHPN2Q8IUC4 686 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 PIGOQ8TEQ8 1089 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 SCLT1Q96NL6 688 aa27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TM7SF3-210ENST00000542019 LPXNO60711 386 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 DNM2P50570 870 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PTGDRQ13258 359 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 DSC3Q14574 896 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 EMC2Q15006 297 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 CATSPER3Q86XQ3 398 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC7A3Q8WY07 619 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 DGKIO75912 1065 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 RFC5P40937 340 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 GATMP50440 423 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 GRB10Q13322 594 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 NLRP4Q96MN2 994 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 RGS18Q9NS28 235 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 MYO9BQ13459 2157 aa27.75■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 DENND3A2RUS2 1198 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 C9IYK1 514 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 LINC00271P0C7V0 271 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 RARRES1P49788 294 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 IL17AQ16552 155 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PPM1EQ8WY54 764 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PPME1Q9Y570 386 aa27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ODR4Q5SWX8 454 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 POTEGQ6S5H5 508 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 TUFT1Q9NNX1 390 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ANKEF1Q9NU02 776 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 MTCH2Q9Y6C9 303 aa27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ECM1Q16610 540 aa27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF410Q86VK4 478 aa27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 MTRQ99707 1265 aa27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 IFT122Q9HBG6 1241 aa27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 TRANK1O15050 2925 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 EPC2Q52LR7 807 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 FIBCD1Q8N539 461 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PRDM6Q9NQX0 595 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3-210ENST00000542019 PP2D1A8MPX8 630 aa27.7■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 RPA1P27694 616 aa27.7■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.7■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.7■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 STAG3L1P0CL83 205 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 CDC42EP1Q00587 391 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 FERMT3Q86UX7 667 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM192Q8IY95 271 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 ERMNQ8TAM6 284 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 MINDY3Q9H8M7 445 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 REV3LO60673 3130 aa27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 USO1O60763 962 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM189BP81408 668 aa27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 TCP11Q8WWU5 503 aa27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 KIAA1671Q9BY89 1806 aa27.67■■■□□ 2.02
TM7SF3-210ENST00000542019 DGAT1O75907 488 aa27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms