RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 MCM6Q14566 821 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 MBTPS1Q14703 1052 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 GPNMBQ14956 572 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 E2F4Q16254 413 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF410Q86VK4 478 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 IQUBQ8NA54 791 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 PANK2Q9BZ23 570 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 CUEDC2Q9H467 287 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 HPSEQ9Y251 543 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-210ENST00000533686 TCHHQ07283 1943 aa18.27■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.27■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 NBNO60934 754 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GPC3P51654 580 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 POU5F1BQ06416 359 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 SV2BQ7L1I2 683 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PDILTQ8N807 584 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 USP38Q8NB14 1042 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KIFAP3Q92845 792 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GDF15Q99988 308 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 IL23AQ9NPF7 189 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PFKFB1P16118 471 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KIZQ2M2Z5 673 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ARSHQ5FYA8 562 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GPBP1Q86WP2 473 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 VWCEQ96DN2 955 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ARID2Q68CP9 1835 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 LTBP2Q14767 1821 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 EVPLQ92817 2033 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GVL5 298 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GLRA2P23416 452 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 BMP8BP34820 402 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TFDP1Q14186 410 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 LPIN1Q14693 890 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 FSIP1Q8NA03 581 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 NLRP7Q8WX94 980 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DHX58Q96C10 678 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DRC1Q96MC2 740 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 USP25Q9UHP3 1055 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087WZ62 844 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GHRP10912 638 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ODR4Q5SWX8 454 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DEFB128Q7Z7B8 93 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KSR1Q8IVT5 923 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 DAW1Q8N136 415 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 OSMRQ99650 979 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC27Q9C0I9 530 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 TNMDQ9H2S6 317 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 GINS2Q9Y248 185 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 HIP1RO75146 1068 aa18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 SYKP43405 635 aa18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 NDUFA8P51970 172 aa18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3-210ENST00000533686 EPHB4P54760 987 aa18.22■□□□□ 0.51
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