RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 SAMM50Q9Y512 469 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 CEP83Q9Y592 693 aa22.12■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 GGCXP38435 758 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 EHHADHQ08426 723 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 CNPY4Q8N129 248 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 SFI1A8K8P3 1242 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 B4DLN1 442 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 LIG3P49916 1009 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 SPRYD7Q5W111 196 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 FGD4Q96M96 766 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 REEP2Q9BRK0 252 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 EPHA7Q15375 998 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 MCM3APO60318 1980 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 RUBCNQ92622 972 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 AGPSO00116 658 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-214ENST00000531473 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.08■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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TSTA3-214ENST00000531473 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 CHADLQ6NUI6 762 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 NUP58Q9BVL2 599 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 ABL1P00519 1130 aa22.07■■□□□ 1.12
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TSTA3-214ENST00000531473 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 IQCEQ6IPM2 695 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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TSTA3-214ENST00000531473 RETREG2Q8NC44 543 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 GPRASP2Q96D09 838 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.06■■□□□ 1.12
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TSTA3-214ENST00000531473 CENPPQ6IPU0 288 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 STXBP2Q15833 593 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 NLRX1Q86UT6 975 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 SFR1Q86XK3 245 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-214ENST00000531473 MMS19Q96T76 1030 aa22.05■■□□□ 1.12
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