RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.41□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.41□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.41□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 B4GALT4O60513 344 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 CUTAO60888 179 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ITGB3P05106 788 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 KCNQ1P51787 676 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 EPHB4P54760 987 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 PHC1P78364 1004 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF174Q15697 407 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 LGI4Q8N135 537 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 OR2W6PQ8NHA6 318 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 RELTQ969Z4 430 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 MYL10Q9BUA6 226 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 POFUT1Q9H488 388 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 VTA1Q9NP79 307 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.4□□□□□ -1.54
CLVS1-209ENST00000522928 ADCY10Q96PN6 1610 aa5.4□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 MAPKBP1O60336 1514 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0G2JNJ9 132 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 GPR42O15529 346 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PLATP00750 562 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 STAT5BP51692 787 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 HGFACQ04756 655 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP8Q13202 625 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PDCD1Q15116 288 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 RNF151Q2KHN1 245 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 TTC38Q5R3I4 469 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 UBXN11Q5T124 520 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 SOX7Q9BT81 388 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 Q9UFV3 132 aa5.39□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 B8ZZF3 427 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2CBP62714 309 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2CAP67775 309 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ROM1Q03395 351 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 STRN3Q13033 797 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PCOLCEQ15113 449 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 BROXQ5VW32 411 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 DNERQ8NFT8 737 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.38□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0A6YYJ9 748 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 LAMTOR5O43504 91 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CELA3BP08861 270 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 IL2P60568 153 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 NFYCQ13952 458 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 BORAQ6PGQ7 559 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 FAM124AQ86V42 546 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 NME9Q86XW9 330 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CMIPQ8IY22 773 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CALML6Q8TD86 181 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO41Q8TF61 875 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 SLC5A5Q92911 643 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO10Q9UK96 956 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PTPRGP23470 1445 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.37□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS38A1L453 326 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 C2orf78A6NCI8 922 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ZEB2O60315 1214 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 HMGCRP04035 888 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 PFKMP08237 780 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 MRE11P49959 708 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ADAM8P78325 824 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.36□□□□□ -1.55
CLVS1-209ENST00000522928 ADCY2Q08462 1091 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms