RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GMIPQ9P107 970 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLEC1BQ9P126 229 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TLR6Q9Y2C9 796 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 AOX1Q06278 1338 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE12BA1L429 117 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM221AA4D161 298 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GAGE12HA6NDE8 117 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GOLGA8BA8MQT2 603 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SOCS2O14508 198 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 USP17L7P0C7H9 530 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 UBTFP17480 764 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ADAM15Q13444 863 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDB1Q16531 1140 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SEZ6Q53EL9 994 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 EMC4Q5J8M3 183 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CD276Q5ZPR3 534 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 OVOS1Q6IE37 1185 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC18B1Q6NT16 456 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q6ZNX1 250 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 OTOP2Q7RTS6 562 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GDF7Q7Z4P5 450 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRIM48Q8IWZ4 208 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 VSIG10Q8N0Z9 540 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CLEC4DQ8WXI8 215 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ST8SIA2Q92186 375 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SARAFQ96BY9 339 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM169Q96HH4 297 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q96MF0 132 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SEMA4CQ9C0C4 833 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SMOC1Q9H4F8 434 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CNNM2Q9H8M5 875 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 FBXO10Q9UK96 956 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 LINC01548A6NM66 108 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SPDEFO95238 335 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 PLS3P13797 630 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAHP16930 419 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 GNAT2P19087 354 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 WT1P19544 449 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CD247P20963 164 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 FDXRP22570 491 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 RPL11P62913 178 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 UBE3CQ15386 1083 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 INF2Q27J81 1249 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ANKRD39Q53RE8 183 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 IQSEC1Q6DN90 963 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 TTLL11Q8NHH1 800 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ACTRT2Q8TDY3 377 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF524Q96C55 264 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 ATG4CQ96DT6 458 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SH2D3AQ9BRG2 576 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 EGLN1Q9GZT9 426 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC39A2Q9NP94 309 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRO0461Q9UI25 63 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 MTMR7Q9Y216 660 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-687P-201ENST00000516443 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 MAFKO60675 156 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 F13A1P00488 732 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ITGA4P13612 1032 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 BCL6P41182 706 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ADCY7P51828 1080 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ASIC2Q16515 512 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM119Q4V9L6 283 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 NLRC3Q7RTR2 1065 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 SYT12Q8IV01 421 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 NRACQ8N912 160 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 REPS2Q8NFH8 660 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 GATAD2BQ8WXI9 593 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 DMRTB1Q96MA1 342 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPHA2Q96T91 129 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 MMP19Q99542 508 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 TIMP4Q99727 224 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 ADAM2Q99965 735 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 HERPUD2Q9BSE4 406 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 HAPLN2Q9GZV7 340 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-687P-201ENST00000516443 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms