RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 TMX1Q9H3N1 280 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 ARHGEF15O94989 841 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 PTGDRQ13258 359 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 EMC2Q15006 297 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 SAMD11Q96NU1 681 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 MTRQ99707 1265 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 CERS4Q9HA82 394 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX1-206ENST00000507253 MUTP22033 750 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 PRPHP41219 470 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ERVK-21P61565 698 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ADAM2Q99965 735 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 MYO9BQ13459 2157 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DGAT1O75907 488 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 IGFBP4P22692 258 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RPA1P27694 616 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 BRAPQ7Z569 592 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 NLRP4Q96MN2 994 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RGS18Q9NS28 235 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ASAP2O43150 1006 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RARRES1P49788 294 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 PDIA5Q14554 519 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 SNX21Q969T3 373 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 NACC1Q96RE7 527 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CDH23Q9H251 3354 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 A0A087WZ62 844 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ZBTB39O15060 712 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 MGEA5O60502 916 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 MED24O75448 989 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 FIBCD1Q8N539 461 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 TMEM143Q96AN5 459 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DGKIO75912 1065 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ADGRE1Q14246 886 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DSC3Q14574 896 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 HSCBQ8IWL3 235 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 IGSF22Q8N9C0 903 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 C9IYK1 514 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 POTEGQ6S5H5 508 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 DACT1Q9NYF0 836 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-206ENST00000507253 EPOPA6NHQ4 379 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 BMP15O95972 392 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 TFDP1Q14186 410 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 KRT79Q5XKE5 535 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 FERMT3Q86UX7 667 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 KSR1Q8IVT5 923 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 C17orf80Q9BSJ5 609 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 CHST12Q9NRB3 414 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-206ENST00000507253 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms