RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 STK32AQ8WU08 396 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NXPE3Q969Y0 559 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RMDN1Q96DB5 314 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC77Q9BR77 488 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 VPS16Q9H269 839 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 DACT1Q9NYF0 836 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ALAS2P22557 587 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM23P36406 574 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 EMP3P54852 163 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NNTQ13423 1086 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TTMPQ5BVD1 217 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PASD1Q8IV76 773 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 LZTR1Q8N653 840 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GAB3Q8WWW8 586 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CEP19Q96LK0 163 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SELENONQ9NZV5 590 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NUP160Q12769 1436 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ACEP12821 1306 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CTAGE9A4FU28 777 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PIK3CDO00329 1044 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 STX6O43752 255 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GNAI2P04899 355 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SLC1A1P43005 524 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RAD23BP54727 409 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCB1Q12824 385 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FYB2Q5VWT5 728 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RUFY3Q7L099 469 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HECW1Q76N89 1606 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ORC4O43929 436 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 UBXN1Q04323 297 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R5CQ13362 524 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CUL1Q13616 776 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 LETM2Q2VYF4 491 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 UCMAQ8WVF2 138 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RUBCNQ92622 972 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SGK3Q96BR1 496 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 NLRP4Q96MN2 994 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 COQ7Q99807 217 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KLHL3Q9UH77 587 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CEP170Q5SW79 1584 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TLDC2A0PJX2 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CARNS1A5YM72 827 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 CENPBD1B2RD01 187 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 IKBKBO14920 756 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PFDN6O15212 129 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 EPN2O95208 641 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DRAP01903 254 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 KRT13P13646 458 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 TXKP42681 527 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 ECE1P42892 770 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-216ENST00000507116 MAPKAPK2P49137 400 aa6.62□□□□□ -1.35
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