RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IFT74Q96LB3 600 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CSRNP2Q9H175 543 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STK17AQ9UEE5 414 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR32O75388 356 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 VTNP04004 478 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SCP2P22307 547 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCD1P33897 745 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PHKA2P46019 1235 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ME1P48163 572 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 LPIN1Q14693 890 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 KIZQ2M2Z5 673 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RASIP1Q5U651 963 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DRC1Q96MC2 740 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CHST12Q9NRB3 414 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM150BA6NC51 233 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC25AP30304 524 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 EPHB4P54760 987 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PKP1Q13835 747 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 MBTPS1Q14703 1052 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB30Q15771 203 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR153Q6NV75 609 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM143Q96AN5 459 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA32Q96LK8 384 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 OSMRQ99650 979 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 CUEDC2Q9H467 287 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DACT1Q9NYF0 836 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PP2D1A8MPX8 630 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB39O15060 712 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 STAG3L1P0CL83 205 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SKIP12755 728 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 GUCY2CP25092 1073 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DDIT3P35638 169 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL2P36404 184 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP4Q96MN2 994 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 MSRAQ9UJ68 235 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PADI3Q9ULW8 664 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 TANC1Q9C0D5 1861 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR81Q562E7 1941 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WZ62 844 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 DENND3A2RUS2 1198 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 H0YCG3 227 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G4BP0C869 781 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 AXLP30530 894 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 NAMPTP43490 491 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 EFNA5P52803 228 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 AMPD3Q01432 767 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 GRB10Q13322 594 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 GPNMBQ14956 572 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ECM1Q16610 540 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 IQUBQ8NA54 791 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF149Q8NC42 400 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 PNMA5Q96PV4 448 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms