RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM247A6NEH6 219 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBED4O75132 1171 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS6KA5O75582 802 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 C7P10643 843 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 UBL4AP11441 157 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ADORA1P30542 326 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 BMP8BP34820 402 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PMS2P54278 862 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP2K5Q13163 448 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CUL3Q13618 768 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC41Q15345 812 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 GRIK5Q16478 980 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC121Q6ZUS5 278 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CABP7Q86V35 215 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM50Q86XT4 487 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TDHQ8IZJ6 230 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP7Q8WX94 980 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC17Q96LX7 622 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TTPALQ9BTX7 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 HPS4Q9NQG7 708 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 HESX1Q9UBX0 185 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 GABRQQ9UN88 632 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1B0GVG6 124 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL3P08590 195 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CES1P23141 567 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 HSD17B2P37059 387 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-9P63128 1117 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-24P63145 666 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA7Q13683 1181 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF180Q86T96 592 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 AADATQ8N5Z0 425 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SPERTQ8NA61 448 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 KAZALD1Q96I82 304 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX27Q96L92 541 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIS3Q99687 375 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MROH8Q9H579 483 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 STAP2Q9UGK3 403 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM232C9JQI7 657 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 B4GALT4O60513 344 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A27O95847 323 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MTX1Q13505 466 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP7Q14244 749 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PLBD1Q6P4A8 553 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB123Q8N688 67 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM107BQ9H098 131 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PARVGQ9HBI0 331 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 BATF3Q9NR55 127 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRKQ9NRH2 765 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 B4DLN1 442 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ABLIM1O14639 778 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ANXA13P27216 316 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 NR2C2P49116 596 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K10Q02779 954 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ISM2Q6H9L7 571 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 OR8H2Q8N162 312 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 LPAR1Q92633 364 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CCT7Q99832 543 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 AK9Q5TCS8 1911 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms