RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TRIM50Q86XT4 487 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 C7orf31Q8N865 590 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SPATA20Q8TB22 786 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 DDX12PQ92771 950 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KIFAP3Q92845 792 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 DRC1Q96MC2 740 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RNPEPQ9H4A4 650 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa12.98□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 NCOR1O75376 2440 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 DPYDQ12882 1025 aa12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 C17orf102A2RUQ5 167 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MYMKA6NI61 221 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB39O15060 712 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TBCAO75347 108 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa12.96□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 SARSP49591 514 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 NPEPPSP55786 919 aa12.96□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GRIK4Q16099 956 aa12.96□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 ARSHQ5FYA8 562 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 C1orf53Q5VUE5 145 aa12.96□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 IER5Q5VY09 327 aa12.96□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 PPM1EQ8WY54 764 aa12.96□□□□□ -0.33
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NISCH-211ENST00000488243 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQY0 241 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB42B2RXF5 422 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 H0YCG3 227 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 USO1O60763 962 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 RHOBTB3O94955 611 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 KIF20AO95235 890 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 RPN1P04843 607 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 ZNF131P52739 623 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 ASIC1P78348 528 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 ADAM17P78536 824 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 POU5F1BQ06416 359 aa12.95□□□□□ -0.34
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NISCH-211ENST00000488243 ALCAMQ13740 583 aa12.95□□□□□ -0.34
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NISCH-211ENST00000488243 EMC2Q15006 297 aa12.95□□□□□ -0.34
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NISCH-211ENST00000488243 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 TAF2Q6P1X5 1199 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 NME8Q8N427 588 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 SLC43A3Q8NBI5 491 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 KCNN1Q92952 543 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 PARVGQ9HBI0 331 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 OLFML3Q9NRN5 406 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 EXOC1Q9NV70 894 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 MROH7Q68CQ1 1323 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0355O15063 1070 aa12.94□□□□□ -0.34
NISCH-211ENST00000488243 FAM13AO94988 1023 aa12.94□□□□□ -0.34
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