RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MORC4Q8TE76 937 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP170P1Q96L14 293 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 STRA6Q9BX79 667 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PORCNQ9H237 461 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 EFCC1Q9HA90 598 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF302Q9NR11 478 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM184BQ9ULE4 1060 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.41□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PQJ5 194 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC26A0AVF1 554 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ASB14A6NK59 587 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 USP27XA6NNY8 438 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TGFB1I1O43294 461 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 DGAT1O75907 488 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT9P35527 623 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNA1Q09470 495 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 METTL7BQ6UX53 244 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ABRAQ8N0Z2 381 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 KIFAP3Q92845 792 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ARMC5Q96C12 935 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 GBP3Q9H0R5 595 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 CPA4Q9UI42 421 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN12O43309 604 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GGPS1O95749 300 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 OATP04181 439 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 KLK7P49862 253 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 NCKAP1LP55160 1127 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 RTP1P59025 263 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 MYBPC2Q14324 1141 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 HVCN1Q96D96 273 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ACCSQ96QU6 501 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAJC7Q99615 494 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM206Q9H813 350 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ARID2Q68CP9 1835 aa11.39□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 CLIC2O15247 247 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 STRNO43815 780 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 AKAP3O75969 853 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ADORA2AP29274 412 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SMTNP53814 917 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PEX3P56589 373 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBED6P86452 979 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 GTF2BQ00403 316 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPN14Q15678 1187 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.38□□□□□ -0.59
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF792Q3KQV3 632 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms