RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CERS4Q9HA82 394 aa22.22■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 ARID2Q68CP9 1835 aa22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 TRANK1O15050 2925 aa22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.21■■□□□ 1.15
CTPS1-206ENST00000470271 DENND3A2RUS2 1198 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 LINC01553A4QN01 128 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MGEA5O60502 916 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MED24O75448 989 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RPA1P27694 616 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PDIA5Q14554 519 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 EMC2Q15006 297 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF410Q86VK4 478 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM143Q96AN5 459 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM2Q99965 735 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RAB34Q9BZG1 259 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.2■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087WZ62 844 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PRPHP41219 470 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RARRES1P49788 294 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 BRAPQ7Z569 592 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 KSR1Q8IVT5 923 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 TCP11Q8WWU5 503 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP4Q96MN2 994 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 NACC1Q96RE7 527 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MTRQ99707 1265 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RGS18Q9NS28 235 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.19■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 A0A087WWV3 80 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 DGAT1O75907 488 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 POTEGQ6S5H5 508 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SPRED2Q7Z698 418 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 STK24Q9Y6E0 443 aa22.18■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 STAG3L1P0CL83 205 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SYT1P21579 422 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MUTP22033 750 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ERVK-21P61565 698 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRE1Q14246 886 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 HSCBQ8IWL3 235 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 COL4A6Q14031 1691 aa22.17■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 EPOPA6NHQ4 379 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RFXAPO00287 272 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ASAP2O43150 1006 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 DGKIO75912 1065 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 FGFR4P22455 802 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 IGFBP4P22692 258 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 DSC3Q14574 896 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 IL17AQ16552 155 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 FERMT3Q86UX7 667 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.16■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 C9IYK1 514 aa22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.15■■□□□ 1.14
CTPS1-206ENST00000470271 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 KRT79Q5XKE5 535 aa22.14■■□□□ 1.13
CTPS1-206ENST00000470271 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms