RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 COL4A6Q14031 1691 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 DENND3A2RUS2 1198 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 LCHNA4D1U4 455 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 STAG3L1P0CL83 205 aa16.46■□□□□ 0.23
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SH3BP1-205ENST00000466097 BRAPQ7Z569 592 aa16.46■□□□□ 0.23
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SH3BP1-205ENST00000466097 C4orf32Q8N8J7 132 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01599Q8WXQ3 324 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 SNX21Q969T3 373 aa16.46■□□□□ 0.23
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SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD7Q9P2D1 2997 aa16.46■□□□□ 0.23
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB39O15060 712 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 PDIA5Q14554 519 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 NACC1Q96RE7 527 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF15O94989 841 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MYH11P35749 1972 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087WZ62 844 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 ERVK-21P61565 698 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 MGEA5O60502 916 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 BMP15O95972 392 aa16.42■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 KSR1Q8IVT5 923 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FIBCD1Q8N539 461 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 C9IYK1 514 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-205ENST00000466097 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
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SH3BP1-205ENST00000466097 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.41■□□□□ 0.22
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