RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF862O60290 1169 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CUTAO60888 179 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SLITRK3O94933 977 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PLCB4Q15147 1175 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ECM1Q16610 540 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT79Q5XKE5 535 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ERMNQ8TAM6 284 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 EPSTI1Q96J88 318 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PNMA5Q96PV4 448 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK15Q96Q40 435 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LXNQ9BS40 222 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ALPK3Q96L96 1907 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIN2DO15399 1336 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM150BA6NC51 233 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 HAS3O00219 553 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CABYRO75952 493 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 STBD1O95210 358 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 F2P00734 622 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 COL6A1P12109 1028 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RPA1P27694 616 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 UBA7P41226 1012 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKCEQ02156 737 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 GRB10Q13322 594 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGA7Q13683 1181 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SHC4Q6S5L8 630 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CABP7Q86V35 215 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 NEK9Q8TD19 979 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 AK8Q96MA6 479 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PANK2Q9BZ23 570 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 DACH1Q9UI36 760 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.41□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 E9PMD0 336 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CAPN2P17655 700 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 IGBP1P78318 339 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 XKR3Q5GH77 459 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RESP18Q5W5W9 173 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNK18Q7Z418 384 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C4orf19Q8IY42 314 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C7orf31Q8N865 590 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CALML4Q96GE6 196 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SETD4Q9NVD3 440 aa9.4□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MYH11P35749 1972 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A087X0B3 334 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GVL5 298 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 ARVCFO00192 962 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 HBP1O60381 514 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 LYPLA2O95372 231 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 ADH1CP00326 375 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 INSRRP14616 1297 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 PLCG1P19174 1290 aa9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC26A2P50443 739 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms