RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GNG11P61952 73 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2BQ00403 316 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KCNH2Q12809 1159 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ALCAMQ13740 583 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ANO5Q75V66 913 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35F6Q8N357 371 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 CHST13Q8NET6 341 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LMO3Q8TAP4 145 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 SYT17Q9BSW7 474 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 BTBD7Q9P203 1132 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PLXNB2O15031 1838 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SFI1A8K8P3 1242 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 WDR64B1ANS9 1081 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 BACH1O14867 736 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK13O15264 365 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 PPATQ06203 517 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FSTL1Q12841 308 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PPIL2Q13356 520 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 NSMFQ6X4W1 530 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 DNERQ8NFT8 737 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MORC4Q8TE76 937 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 MAP7D2Q96T17 732 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CDC23Q9UJX2 597 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TFR2Q9UP52 801 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
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