RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 PI16Q6UXB8 463 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 UCMAQ8WVF2 138 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 APPBP2Q92624 585 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 DPH5Q9H2P9 285 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 THSD7BQ9C0I4 1608 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-203ENST00000439720 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 FLOT1O75955 427 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DEXIO95424 95 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 PLS1Q14651 629 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM20Q15388 145 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DBN1Q16643 649 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC24Q50LG9 513 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D9BQ66K14 1250 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SCYL1Q96KG9 808 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT23Q9C075 422 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 VCXQ9H320 206 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQJ5 194 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 LCA5LO95447 670 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX5P50542 639 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSWP56202 376 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE3CQ15386 1083 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TTI2Q6NXR4 508 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 PREBQ9HCU5 417 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 AMACRQ9UHK6 382 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP104O60308 925 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 PRDM1O75626 825 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 CALB2P22676 271 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRC1P26715 233 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SCARF1Q14162 830 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC14Q15048 493 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MIIPQ5JXC2 388 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ASRGL1Q7L266 308 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 FITM2Q8N6M3 262 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 JDP2Q8WYK2 163 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA4Q96DD7 197 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 NDNQ99608 321 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 AZI2Q9H6S1 392 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT8Q9NY28 637 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX11AO75192 247 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP13P45452 471 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 HOOK3Q86VS8 718 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 OGFOD1Q8N543 542 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 MGARPQ8TDB4 240 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 OPTNQ96CV9 577 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ZWILCHQ9H900 591 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 POM121CA8CG34 1229 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YIN7 160 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 SUN1O94901 812 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 TPBGLP0DKB5 382 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 ADORA1P30542 326 aa9.07□□□□□ -0.96
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms