RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC3O60645 756 aa25.4■■□□□ 1.66
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FAAP20-209ENST00000428120 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 GCNT4Q9P109 453 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.39■■□□□ 1.66
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FAAP20-209ENST00000428120 TRIM49CP0CI26 452 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ARID3AQ99856 593 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO40Q9UH90 709 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.39■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC169A6NNP5 214 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 POTEB2H3BUK9 544 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CXCL11O14625 94 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 KRT86O43790 486 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CNMDO75829 334 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 STBD1O95210 358 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 PRKCEQ02156 737 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 GBP6Q6ZN66 633 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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FAAP20-209ENST00000428120 SOWAHBA6NEL2 793 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 UCHL3P15374 230 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 VAV2P52735 878 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ACCSQ96QU6 501 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.38■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.38■■□□□ 1.65
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FAAP20-209ENST00000428120 GPR162Q16538 588 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 GJB7Q6PEY0 223 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM206Q9H813 350 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ENC1O14682 589 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 TADA3O75528 432 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 KIF5AQ12840 1032 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 PPIL2Q13356 520 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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FAAP20-209ENST00000428120 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SERPING1P05155 500 aa25.36■■□□□ 1.65
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FAAP20-209ENST00000428120 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 NPTX2P47972 431 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CBWD6Q4V339 395 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SPAG5Q96R06 1193 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 GLTPD2A6NH11 291 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 FMO5P49326 533 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 NCKAP1LP55160 1127 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ALCAMQ13740 583 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 Q3C1V9 767 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MAF1Q9H063 256 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SIX2Q9NPC8 291 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.35■■□□□ 1.65
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FAAP20-209ENST00000428120 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ICAM3P32942 547 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ASIC2Q16515 512 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MTERF2Q49AM1 385 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN4Q92575 508 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 CDC23Q9UJX2 597 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 GJA5P36382 358 aa25.34■■□□□ 1.65
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