RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PPME1Q9Y570 386 aa27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 INSL6Q9Y581 213 aa27.91■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 FGFR4P22455 802 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 EMC2Q15006 297 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17AQ16552 155 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 ODR4Q5SWX8 454 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.9■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A087WZ62 844 aa27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 MGEA5O60502 916 aa27.89■■■□□ 2.06
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HTATSF1-202ENST00000425695 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 NLRP4Q96MN2 994 aa27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 YME1L1Q96TA2 773 aa27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAM2Q99965 735 aa27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC3P53804 2025 aa27.89■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 ARID2Q68CP9 1835 aa27.88■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC42EP1Q00587 391 aa27.88■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 BRAPQ7Z569 592 aa27.88■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 PRPHP41219 470 aa27.87■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 RAB34Q9BZG1 259 aa27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa27.87■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC01553A4QN01 128 aa27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC25AP30304 524 aa27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 ECM1Q16610 540 aa27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF22Q8N9C0 903 aa27.86■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HTATSF1-202ENST00000425695 CHD7Q9P2D1 2997 aa27.86■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa27.85■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF149Q8NC42 400 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
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HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 STK24Q9Y6E0 443 aa27.82■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF35A5YM69 484 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 C9IYK1 514 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 ASAP2O43150 1006 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 GATMP50440 423 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVK-21P61565 698 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
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