RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 CTSHP09668 335 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ARL2P36404 184 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GPNMBQ14956 572 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 LRRC15Q8TF66 581 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GDF15Q99988 308 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TIPINQ9BVW5 301 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 IL23AQ9NPF7 189 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MYH11P35749 1972 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CXCL10P02778 98 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PFKMP08237 780 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 STAT6P42226 847 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MCM6Q14566 821 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MBTPS1Q14703 1052 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PDILTQ8N807 584 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 IQUBQ8NA54 791 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 USP38Q8NB14 1042 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CUEDC2Q9H467 287 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TET1Q8NFU7 2136 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 NBNO60934 754 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GUCY2CP25092 1073 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GPC3P51654 580 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 KIZQ2M2Z5 673 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 SV2BQ7L1I2 683 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ZNF410Q86VK4 478 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 CEP290O15078 2479 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 BMP8BP34820 402 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 POU5F1BQ06416 359 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 E2F4Q16254 413 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 KIFAP3Q92845 792 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 VWCEQ96DN2 955 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 HPSEQ9Y251 543 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 A0A1B0GVL5 298 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ARSHQ5FYA8 562 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GPBP1Q86WP2 473 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GINS2Q9Y248 185 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PFKFB1P16118 471 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GLRA2P23416 452 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TFDP1Q14186 410 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 LPIN1Q14693 890 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ODR4Q5SWX8 454 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 KSR1Q8IVT5 923 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FSIP1Q8NA03 581 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 NLRP7Q8WX94 980 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 DHX58Q96C10 678 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 DRC1Q96MC2 740 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 SCLT1Q96NL6 688 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 OSMRQ99650 979 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 USP25Q9UHP3 1055 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 A0A087WZ62 844 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 HIP1RO75146 1068 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FGBP02675 491 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 GHRP10912 638 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 EPHB4P54760 987 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 IFT74Q96LB3 600 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 NLRP4Q96MN2 994 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-211ENST00000424766 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.83■■□□□ 1.25
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