RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM170AA1A519 330 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT8L1PA6NM43 557 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB5O15062 677 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FLOT1O75955 427 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SFR1Q86XK3 245 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM212AQ96EL1 285 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNMB3Q9NPA1 279 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1G2O95670 118 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC15A2Q16348 729 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF9Q3BBW0 867 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD5Q7Z6J6 570 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 DAAM2Q86T65 1068 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM114A2Q9NRY5 505 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa19.9■□□□□ 0.78
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP4P49662 377 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 GIT2Q14161 759 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CRYMQ14894 314 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC197Q8NCU1 140 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 REEP2Q9BRK0 252 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 DPH5Q9H2P9 285 aa19.89■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CLGNO14967 610 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SLURP2P0DP57 97 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHA7Q15375 998 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 EP400NLQ6ZTU2 488 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SLFN11Q7Z7L1 901 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 NOD2Q9HC29 1040 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SIX2Q9NPC8 291 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD21O60216 631 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIA2O75334 1257 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKCIP41743 596 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SLF2Q8IX21 1173 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 GCNT4Q9P109 453 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA2Q9UL42 364 aa19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SLX4Q8IY92 1834 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CAND2O75155 1236 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFZP0C0S5 128 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFVQ71UI9 128 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5DC3Q86UY8 548 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM31Q9BZY9 425 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 NENFQ9UMX5 172 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH10B2B2RC85 870 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 G3V3G9 751 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 H0YIN7 160 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH10BP0C881 870 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 JAM2P57087 298 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNA1Q09470 495 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R7Q15435 360 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CHADLQ6NUI6 762 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35C1Q96A29 364 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO3Q9BYT9 981 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 NR2E1Q9Y466 385 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa19.87■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 GFPT2O94808 682 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SPIRE1Q08AE8 756 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SPDYCQ5MJ68 293 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM51Q9BSJ1 452 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CLIC2O15247 247 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 NR3C1P04150 777 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CHN1P15882 459 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR16Q569H4 304 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 IKZF4Q9H2S9 585 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINB13Q9UIV8 391 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ASTN1O14525 1302 aa19.86■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC189A1A4V9 331 aa19.85■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 ASAP2O43150 1006 aa19.85■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 FGGP02679 453 aa19.85■□□□□ 0.77
RALGPS1-208ENST00000424082 GSTA1P08263 222 aa19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms