RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KA1Q15418 735 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MREGQ8N565 214 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MYCT1Q8N699 235 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FEM1BQ9UK73 627 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GAS7O60861 476 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CFBP00751 764 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 BCRP11274 1271 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 STAT1P42224 750 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PAK2Q13177 524 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FIZ1Q96SL8 496 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GCNT4Q9P109 453 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 A6NNZ2 444 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CCDC172P0C7W6 258 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 RFX1P22670 979 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ECE1P42892 770 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CASP4P49662 377 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PPFIA1Q13136 1202 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TUBB8Q3ZCM7 444 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TPH2Q8IWU9 490 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 USP38Q8NB14 1042 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PACSIN1Q9BY11 444 aa25.93■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PHACTR2O75167 634 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FTCDO95954 541 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ALCAMQ13740 583 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SYCE1Q8N0S2 351 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PSMB7Q99436 277 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 STRA6Q9BX79 667 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 STK33Q9BYT3 514 aa25.92■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 KIF4AO95239 1232 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 H2AFZP0C0S5 128 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 H2AFVQ71UI9 128 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ACER1Q8TDN7 264 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MS4A14Q96JA4 679 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TULP2O00295 520 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A5Q01650 507 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GHRHRQ02643 423 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 WHAMMQ8TF30 809 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 EHD2Q9NZN4 543 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.9■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 KIF3CO14782 793 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 CLIC2O15247 247 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 HSF2BPO75031 334 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FMO5P49326 533 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K10Q02779 954 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TNFAIP1Q13829 316 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SCFD2Q8WU76 684 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 FZD1Q9UP38 647 aa25.89■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R37O75864 691 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 SOX5P35711 763 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 HSD17B4P51659 736 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 KCNA1Q09470 495 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.89■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 CCDC188H7C350 402 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 CD302Q8IX05 232 aa25.88■■□□□ 1.73
PMS1-205ENST00000409985 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms