RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 UBE4BO95155 1302 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ18B7U540 433 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 H3BRB1 525 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 SLC16A4O15374 487 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 ELNP15502 786 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 SPAG1Q07617 926 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM32Q13049 653 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 KCNJ12Q14500 433 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 KSR1Q8IVT5 923 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 CEP89Q96ST8 783 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-204ENST00000402096 A6NJR5 290 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 IGBP1P78318 339 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 KCNA1Q09470 495 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ALCAMQ13740 583 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 RAET1EQ8TD07 263 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 BSNDQ8WZ55 320 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 Q9Y3F1 56 aa22.58■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ADCY3O60266 1144 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HOXD13P35453 343 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NPTX2P47972 431 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CPT1AP50416 773 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NCKAP1LP55160 1127 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CHMP4BP1P59074 171 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SPC24Q8NBT2 197 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EVPLQ92817 2033 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 GNRH1P01148 92 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF6Q15052 776 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PDXKO00764 312 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TPM3P06753 285 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 MYL3P08590 195 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 INSRRP14616 1297 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 RTP1P59025 263 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 BEX3Q00994 111 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TSKSQ9UJT2 592 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R37O75864 691 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 KRT31Q15323 416 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TCP11Q8WWU5 503 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ACCSQ96QU6 501 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 CDC25BP30305 580 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ARL2P36404 184 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 PPP2R5AQ15172 486 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 METTL13Q8N6R0 699 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 STRA6Q9BX79 667 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM206Q9H813 350 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms