RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 USP37Q86T82 979 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM83AQ86UY5 434 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC25Q86WR0 208 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4X1Q8N118 509 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 LINS1Q8NG48 757 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 MAML1Q92585 1016 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC37A3O60309 1634 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 GNA14O95837 355 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 MBD3O95983 291 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CCR3P51677 355 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC12A2P55011 1212 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP14Q86W24 1093 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINC1P01008 464 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 L2HGDHQ9H9P8 463 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CASZ1Q86V15 1759 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNFP41002 786 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 MOGQ16653 247 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 BRAPQ7Z569 592 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO10Q9UK96 956 aa7.37□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 JAMLQ86YT9 394 aa7.36□□□□□ -1.23
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RABGEF1-202ENST00000380828 SULT2A1Q06520 285 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-202ENST00000380828 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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