RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 SCNN1GP51170 649 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 SLC25A3Q00325 362 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 GAGE13Q4V321 117 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM177Q53S58 311 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZRM9 215 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 JMYQ8N9B5 988 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 ZG16BQ96DA0 208 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 GPHA2Q96T91 129 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 BOCQ9BWV1 1114 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRK-202ENST00000368205 C2orf78A6NCI8 922 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TRAF5O00463 557 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 FOXN1O15353 648 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 PRLP01236 227 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MAN2A2P49641 1150 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 PPFIA2O75334 1257 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ATP2B1P20020 1258 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 BPIFB4P59827 614 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 DGKDQ16760 1214 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 BRAPQ7Z569 592 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 PTGS2P35354 604 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ROM1Q03395 351 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 COL10A1Q03692 680 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TCIRG1Q13488 830 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ACAP1Q15027 740 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 HTR3DQ70Z44 454 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 GAREM2Q75VX8 874 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MAML3Q96JK9 1138 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 XDHP47989 1333 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RGS3P49796 1198 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ANTXR2P58335 489 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 CLEC14AQ86T13 490 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ARMC5Q96C12 935 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TCF25Q9BQ70 676 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 TTPALQ9BTX7 342 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 IL23AQ9NPF7 189 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 SNTG2Q9NY99 539 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RABGGTBP53611 331 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 SLC6A3Q01959 620 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MFSD5Q6N075 450 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 GPR87Q9BY21 358 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 ACSS2Q9NR19 701 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2QL1A1L167 161 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 KIF11P52732 1056 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 RBL2Q08999 1139 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 MRGPREQ86SM8 312 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 HAS1Q92839 578 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 LENG9Q96B70 501 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-202ENST00000368205 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 DVL2O14641 736 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RABL3Q5HYI8 236 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 TTC38Q5R3I4 469 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-202ENST00000368205 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms