RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SLITRK3O94933 977 aa24.52■■□□□ 1.52
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HOXD1-201ENST00000331462 ZNF76P36508 570 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 PPATQ06203 517 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF844Q08AG5 666 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 NAA35Q5VZE5 725 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD1-201ENST00000331462 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
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HOXD1-201ENST00000331462 WDR18Q9BV38 432 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 C3orf20Q8ND61 904 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 DACT2Q5SW24 774 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.5■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.5■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 INPP5BP32019 993 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 MYBPC2Q14324 1141 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 CLUL1Q15846 466 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP14Q86W24 1093 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 SFI1A8K8P3 1242 aa24.48■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 KIF22Q14807 665 aa24.48■■□□□ 1.51
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HOXD1-201ENST00000331462 TTI1O43156 1089 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 LIG3P49916 1009 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 PLS1Q14651 629 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 PTPROQ16827 1216 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 CBWD6Q4V339 395 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 TPH2Q8IWU9 490 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 STRA6Q9BX79 667 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 SLX4Q8IY92 1834 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD1-201ENST00000331462 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.47■■□□□ 1.51
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