RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G4BP0C869 781 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ACRP10323 421 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GPC3P51654 580 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 KIZQ2M2Z5 673 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO47Q5MNV8 452 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ADALQ6DHV7 355 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SHC4Q6S5L8 630 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CHRDL2Q6WN34 429 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 RHPN2Q8IUC4 686 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS10Q9H324 1103 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 KCND2Q9NZV8 630 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 STK17AQ9UEE5 414 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GINS2Q9Y248 185 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 MYH11P35749 1972 aa29.73■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ACTN1P12814 892 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 EPHB4P54760 987 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM240Q5SV17 173 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ODR4Q5SWX8 454 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 RINT1Q6NUQ1 792 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF365Q70YC5 407 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF410Q86VK4 478 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa29.72■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 ARL2P36404 184 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SLC12A3P55017 1021 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP7Q8WX94 980 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT8Q92599 483 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 RAD54LQ92698 747 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 VWCEQ96DN2 955 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 SCLT1Q96NL6 688 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 TIPINQ9BVW5 301 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CDHR5Q9HBB8 845 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GHRP10912 638 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 LPIN1Q14693 890 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 FAM102BQ5T8I3 360 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 RESP18Q5W5W9 173 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 APBB2Q92870 758 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R16BQ96T49 567 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PANK2Q9BZ23 570 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 PRO3102Q9H379 93 aa29.71■■■□□ 2.35
CRIP1-201ENST00000330233 CMA1P23946 247 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 POU5F1BQ06416 359 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 TFDP1Q14186 410 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 MAEAQ7L5Y9 396 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 KIFAP3Q92845 792 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 OSMRQ99650 979 aa29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 STAT6P42226 847 aa29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 IKBKEQ14164 716 aa29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 MCM6Q14566 821 aa29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WZ62 844 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PPC1 479 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GPR182O15218 404 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 RPS6KA5O75582 802 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GUCY2CP25092 1073 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 SHHQ15465 462 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 KSR1Q8IVT5 923 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 PDILTQ8N807 584 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 IQUBQ8NA54 791 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 HERVK_113Q902F9 699 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP4Q96MN2 994 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 OSBPL7Q9BZF2 842 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.68■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB14O75071 495 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 BAIAP3O94812 1187 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 DARSP14868 501 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 SV2BQ7L1I2 683 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 TDHQ8IZJ6 230 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC15Q8TF66 581 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 DRC1Q96MC2 740 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.67■■■□□ 2.34
CRIP1-201ENST00000330233 CUEDC2Q9H467 287 aa29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms