RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PGM2Q96G03 612 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPTORQ8N122 1335 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC189A1A4V9 331 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L15C9J2P7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L11C9JVI0 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L18D6R9N7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L22D6RA61 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L19D6RCP7 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L20D6RJB6 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RSPH10BP0C881 870 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNJ2P63252 427 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L24Q0WX57 530 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 GIT2Q14161 759 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLS1Q14651 629 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEBLO76041 1014 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT13P13646 458 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTO1P78417 241 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRYMQ14894 314 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 REEP2Q9BRK0 252 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 FGFR4P22455 802 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NPEPPSP55786 919 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPATQ06203 517 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.16■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC169A6NNP5 214 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITIH4Q14624 930 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PALB2Q86YC2 1186 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRPC6Q9Y210 931 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNQ2O43526 872 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A1B0GUA9 196 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBOX5O94941 541 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANP32DO95626 131 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NR3C1P04150 777 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 LRRC14Q15048 493 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGAP11Q8TF27 550 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFFLQ8WZ73 363 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRHL1Q9NZI5 618 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTUQ9ULD6 942 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 COG5Q9UP83 839 aa24.14■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTN2O75298 545 aa24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASTN1O14525 1302 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDC25CP30307 473 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 STAT1P42224 750 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NFIXQ14938 502 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CERKQ8TCT0 537 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MGARPQ8TDB4 240 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 THAP2Q9H0W7 228 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SFI1A8K8P3 1242 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP17L10C9JJH3 530 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 LDHCP07864 332 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 GSTA1P08263 222 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 FERP16591 822 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 TM4SF1P30408 202 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAPK7Q13164 816 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 EBF2Q9HAK2 575 aa24.13■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKR1B1P15121 316 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CARD9Q9H257 536 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCG2P16885 1265 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLD1P28340 1107 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOVP48745 357 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARCKSL1P49006 195 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP2R5AQ15172 486 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCTD1Q719H9 257 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 AFF2P51816 1311 aa24.12■■□□□ 1.45
GRAMD1A-201ENST00000317991 A8MUI8 341 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms