RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 PSMD2Q13200 908 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SLC15A2Q16348 729 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ACCSLQ4AC99 568 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CNKSR1Q969H4 720 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 RTN2O75298 545 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 NR2F2P24468 414 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 STAT2P52630 851 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CNTNAP1P78357 1384 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SLC9A1P19634 815 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 AP3B2Q13367 1082 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 MREGQ8N565 214 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 BCS1LQ9Y276 419 aa21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TPH2Q8IWU9 490 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 DNM3Q9UQ16 869 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 FAM133AQ8N9E0 248 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TSKSQ9UJT2 592 aa21.09■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 RAD51CO43502 376 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 TRAPPC3O43617 180 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ENTPD3O75355 529 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 EGFRP00533 1210 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 RPA1P27694 616 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 COG2Q14746 738 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 Q4G0T1 1027 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ODF2Q5BJF6 829 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 GJB7Q6PEY0 223 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 DYDC2Q96IM9 177 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.08■□□□□ 0.97
ZNF554-201ENST00000317243 A0A087X0T9 212 aa21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 FAM228BP0C875 321 aa21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 MYZAPP0CAP1 466 aa21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 KCNH2Q12809 1159 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 DLGAP5Q15398 846 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 AKAP3O75969 853 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SERPING1P05155 500 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 ARP10275 920 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 KCNK3O14649 394 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 GCNT3O95395 438 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 SLC8A1P32418 973 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 NAB2Q15742 525 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 WHAMMQ8TF30 809 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 HVCN1Q96D96 273 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 CEP72Q9P209 647 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 RNF14Q9UBS8 474 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 HSD17B3P37058 310 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 XRCC4Q13426 336 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 PLS1Q14651 629 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ZNF554-201ENST00000317243 ABCB11O95342 1321 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms