RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CTAGE9A4FU28 777 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF263O14978 683 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NCKAP1LP55160 1127 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ACTR2P61160 394 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP2R5AQ15172 486 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.55■■□□□ 1.36
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SNRNP25-201ENST00000293861 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ACCSQ96QU6 501 aa23.55■■□□□ 1.36
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SNRNP25-201ENST00000293861 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.55■■□□□ 1.36
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SNRNP25-201ENST00000293861 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GBP6Q6ZN66 633 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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SNRNP25-201ENST00000293861 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM150BA6NC51 233 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF862O60290 1169 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TLR2O60603 784 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GJA5P36382 358 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 NPEPPSP55786 919 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 MNS1Q8NEH6 495 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CARD6Q9BX69 1037 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 DEF6Q9H4E7 631 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 EFCAB8A8MWE9 144 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC9A1P19634 815 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 HVCN1Q96D96 273 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC23Q9UJX2 597 aa23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 RCCD1A6NED2 376 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 AKR1B10O60218 316 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TADA3O75528 432 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP27A1Q02318 531 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25-201ENST00000293861 ATG7O95352 703 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 UCHL3P15374 230 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 SP2Q02086 613 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF5AQ12840 1032 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 KIFAP3Q92845 792 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 PNMA3Q9UL41 463 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 CYP2J2P51589 502 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 PEX3P56589 373 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 FSTL1Q12841 308 aa23.51■■□□□ 1.35
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SNRNP25-201ENST00000293861 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.51■■□□□ 1.35
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SNRNP25-201ENST00000293861 MROH8Q9H579 483 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 SIX2Q9NPC8 291 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 MAPK13O15264 365 aa23.5■■□□□ 1.35
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SNRNP25-201ENST00000293861 RTP1P59025 263 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 APBA1Q02410 837 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 ELF2Q15723 593 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP170P1Q96L14 293 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 PJA2O43164 708 aa23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC3O60645 756 aa23.49■■□□□ 1.35
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