RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 PDIK1LQ8N165 341 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 DR1Q01658 176 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 PP2D1A8MPX8 630 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 NFKBIAP25963 317 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 TMED2Q15363 201 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 PCGF5Q86SE9 256 aa21.72■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 C19orf81C9J6K1 198 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 MT-ND3P03897 115 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 IRX4P78413 519 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 ZNF543Q08ER8 600 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 CALB1P05937 261 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 TJP3O95049 919 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 A0A1B0GUA9 196 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 NTSR2O95665 410 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 CCDC38Q502W7 563 aa21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP25-202ENST00000285681 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ADCY1Q08828 1119 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ZSCAN26Q16670 478 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 NYAP2Q9P242 653 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 NDUFB10O96000 172 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 DBN1Q16643 649 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 KRT39Q6A163 491 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 STX1BP61266 288 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 TFDP2Q14188 446 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 PASD1Q8IV76 773 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SUN1O94901 812 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ITPK1Q13572 414 aa21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 UBE4BO95155 1302 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 FGGP02679 453 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 GPC5P78333 572 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 TTC39CQ8N584 583 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 MADDQ8WXG6 1647 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 GRIN3BO60391 1043 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 STAT5BP51692 787 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 HACL1Q9UJ83 578 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ABCA6Q8N139 1617 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 LRRC53A6NM62 1247 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ZBBXA8MT70 800 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 PMLP29590 882 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SARM1Q6SZW1 724 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ELMOD1Q8N336 334 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SAAL1Q96ER3 474 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 F8W8V4 182 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.69■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 EYA4O95677 639 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CENPUQ71F23 418 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 FAM151AQ8WW52 585 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 FMO2Q99518 471 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 SEMA3FQ13275 785 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 CCDC188H7C350 402 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 PRR29P0C7W0 189 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 EFNA5P52803 228 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 LRRC31Q6UY01 552 aa21.68■■□□□ 1.06
USP25-202ENST00000285681 GANCQ8TET4 914 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms