RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TMC4Q7Z404 712 aa12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPN7Q9Y6W3 813 aa12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.7□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP9BO43861 1147 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL15Q16663 113 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SFR1Q86XK3 245 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SIX5Q8N196 739 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF149Q8NC42 400 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS11Q9H270 941 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ANAPC7Q9UJX3 599 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM247A6NEH6 219 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ETFBP38117 255 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PCSK7Q16549 785 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 AMHR2Q16671 573 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 BTN2A2Q8WVV5 523 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE2Q2LH0YL09 131 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ST8SIA6P61647 398 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RASEFQ8IZ41 740 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SSH3Q8TE77 659 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RAPGEF5Q92565 580 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 AGAP3Q96P47 875 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GBP5Q96PP8 586 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CYTH2Q99418 400 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MYOM2P54296 1465 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCC2Q92887 1545 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MMP1P03956 469 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJB2P25686 324 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CIAO1O76071 339 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CMA1P23946 247 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PYROXD1Q8WU10 500 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC17Q96AE7 1141 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EPB42P16452 691 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HLA-DPA1P20036 260 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 IL31Q6EBC2 164 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SAMD9Q5K651 1589 aa12.69□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RPSAP08865 295 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PAMP19021 973 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RFX3P48380 749 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBB4BP68371 445 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFB5O43674 189 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ALDH1A1P00352 501 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 AKT1P31749 480 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CACUL1Q86Y37 369 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HASPINQ8TF76 798 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MLXIPLQ9NP71 852 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CHEK2O96017 543 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SYTL3Q4VX76 610 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC23LQ6PF05 361 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LMBRD1Q9NUN5 540 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 JAK3P52333 1124 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNYL1Q8N7R7 359 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KLK14Q9P0G3 267 aa12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBB4AP04350 444 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ACAD9Q9H845 621 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 OGFRQ9NZT2 677 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 BCAP29Q9UHQ4 241 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MTMR6Q9Y217 621 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMD14O00487 310 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 HSPA4LO95757 839 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CYBBP04839 570 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DCAF4Q8WV16 495 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 STK17AQ9UEE5 414 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GRAP2O75791 330 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ENDOD1O94919 500 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 BRD1O95696 1058 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms