RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269228.9

NPC1-201, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPC1, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1-201ENST00000269228 RNF139Q8WU17 664 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 TMEM143Q96AN5 459 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 TBX3O15119 743 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 PRPSAP2O60256 369 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 ZNF18P17022 549 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SGO2Q562F6 1265 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 NDUFAB1O14561 156 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 PHBP35232 272 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 CDO1Q16878 200 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 LRRC53A6NM62 1247 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SARM1Q6SZW1 724 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 PASD1Q8IV76 773 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 KCTD6Q8NC69 237 aa14.78□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 VGLL3A8MV65 326 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 EPHX2P34913 555 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 MGARPQ8TDB4 240 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 DGAT1O75907 488 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 INPP5BP32019 993 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.043e-7■■■□□ 16.4
NPC1-201ENST00000269228 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 CHST13Q8NET6 341 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
NPC1-201ENST00000269228 ATP2A3Q93084 1043 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PFASO15067 1338 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 LMNB2Q03252 620 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 BIRC2Q13490 618 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 GPD1LQ8N335 351 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 BBOF1Q8ND07 529 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.77□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 GH1P01241 217 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 KRT39Q6A163 491 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 TEX33O43247 280 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SH3BP5O60239 455 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 CEP57Q86XR8 500 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ZBBXA8MT70 800 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 EFNA5P52803 228 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 KCNB1Q14721 858 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PPM1EQ8WY54 764 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 REEP2Q9BRK0 252 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 BBS5Q8N3I7 341 aa14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 EMSYQ7Z589 1322 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 MCF2LO15068 1137 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 RGL2O15211 777 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PRKCBP05771 671 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 GINM1Q9NU53 330 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 POLIQ9UNA4 740 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 I3L4J1 428 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SAT1P21673 171 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 KIF1AQ12756 1690 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ESYT2A0FGR8 921 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ZMYND10O75800 440 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PSMA2P25787 234 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 CIITAP33076 1130 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 PRPSAP1Q14558 356 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ZWILCHQ9H900 591 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 SCINQ9Y6U3 715 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.75□□□□□ -0.05
NPC1-201ENST00000269228 ICAM1P05362 532 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms