RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RNF170-201ENST00000240159 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.89■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 ACCSQ96QU6 501 aa24.89■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 DNAJC7Q99615 494 aa24.89■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.89■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 DMAC2Q9NW81 257 aa24.89■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 NPTX2P47972 431 aa24.88■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 BSNDQ8WZ55 320 aa24.88■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.88■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 A0A1W2PQJ5 194 aa24.88■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 CCDC169A6NNP5 214 aa24.87■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 SMTNP53814 917 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 RTP1P59025 263 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 KCNH2Q12809 1159 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 GRB14Q14449 540 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 TTLL4Q14679 1199 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 MTF1Q14872 753 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 SCFD2Q8WU76 684 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 BORCS6Q96GS4 357 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.87■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 CCP110O43303 1012 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 ZBED6P86452 979 aa24.86■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.86■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.86■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.86■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 MYBPC2Q14324 1141 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 SPATA33Q96N06 139 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 TNNT1P13805 278 aa24.85■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 HVCN1Q96D96 273 aa24.85■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 VTA1Q9NP79 307 aa24.85■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 TBX20Q9UMR3 447 aa24.85■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 ZSCAN12O43309 604 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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RNF170-201ENST00000240159 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 SLC35C1Q96A29 364 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 TISP43B9A030 160 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 WDR59Q6PJI9 974 aa24.83■■□□□ 1.57
RNF170-201ENST00000240159 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.83■■□□□ 1.57
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