RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229268.12

USP5-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP5, Length 3,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5-201ENST00000229268 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP5-201ENST00000229268 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP5-201ENST00000229268 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.65□□□□□ -0.06
USP5-201ENST00000229268 DENND3A2RUS2 1198 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ZNF263O14978 683 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PSAPP07602 524 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GCLMP48507 274 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 OAZ1P54368 228 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GPRASP2Q96D09 838 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ARHGAP25P42331 645 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KCTD2Q14681 263 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 RETREG2Q8NC44 543 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SLC35C1Q96A29 364 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 RRAGCQ9HB90 399 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.64□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GGPS1O95749 300 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PLS3P13797 630 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GUCY2CP25092 1073 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 BAP1Q92560 729 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SFNP31947 248 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 NPTX2P47972 431 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CBWD6Q4V339 395 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 C4orf19Q8IY42 314 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KCND1Q9NSA2 647 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CTAGE9A4FU28 777 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 TLR2O60603 784 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PON1P27169 355 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KIF5AQ12840 1032 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PDXDC1Q6P996 788 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CHST13Q8NET6 341 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 NEK9Q8TD19 979 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MAGEA1P43355 309 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SEZ6Q53EL9 994 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 UBXN4Q92575 508 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ZNF302Q9NR11 478 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PNMA2Q9UL42 364 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SLC26A4O43511 780 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GFPT2O94808 682 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 UCHL3P15374 230 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SMTNP53814 917 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 IGBP1P78318 339 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KRT83P78385 493 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 GBP6Q6ZN66 633 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.62□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ARIH2O95376 493 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MOCS3O95396 460 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 ZNF131P52739 623 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MMP19Q99542 508 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 KRT13P13646 458 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 CXCR5P32302 372 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 MEA1Q16626 185 aa14.61□□□□□ -0.07
USP5-201ENST00000229268 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms