RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM253P0C7T8 217 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 SCNN1DP51172 638 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 RFFLQ8WZ73 363 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 ERP44Q9BS26 406 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 SIX2Q9NPC8 291 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 USP40Q9NVE5 1235 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.566e-7■■■□□ 18.9
ANKRD54-201ENST00000215941 CYP3A7P24462 503 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 STAT1P42224 750 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 RIPK1Q13546 671 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM228AQ86W67 206 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 NEK9Q8TD19 979 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 FGGP02679 453 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 HSPA6P17066 643 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DR1Q01658 176 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ARSHQ5FYA8 562 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 MBOAT7Q96N66 472 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CFAP73A6NFT4 308 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DCDC2CA8MYV0 355 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 H0YIN7 160 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 POTEB3A0JP26 581 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 POTECB2RU33 542 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PPATQ06203 517 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF543Q08ER8 600 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 POTEBQ6S5H4 581 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PARP2Q9UGN5 583 aa24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 AGTP01019 485 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PMS2P54278 862 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 GALCP54803 685 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ADCY2Q08462 1091 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DENND2CQ68D51 928 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 STYK1Q6J9G0 422 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ERMNQ8TAM6 284 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 TEKT1Q969V4 418 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 DPH5Q9H2P9 285 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SUFUQ9UMX1 484 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CAND2O75155 1236 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 GABPAQ06546 454 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 GIT2Q14161 759 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE2SQ16763 222 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PODNQ7Z5L7 613 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP57Q86XR8 500 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC35C1Q96A29 364 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 GCNT4Q9P109 453 aa24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 MMEP08473 750 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CRYMQ14894 314 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 NFIL3Q16649 462 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB5O15062 677 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 TBX3O15119 743 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 KLRC3Q07444 240 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PLS1Q14651 629 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54-201ENST00000215941 EPB41L4BQ9H329 900 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms