RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsg1l2M0QWL6 290 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Msh3P13705 1091 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgat1P27808 447 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uhmk1P97343 419 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddah1Q9CWS0 285 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Heg1E9Q7X6 1337 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspa1lP16627 641 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MyrflQ3UN70 904 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif5bQ61768 963 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces4aQ8R0W5 563 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf394Q9Z1D9 521 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trappc3O55013 180 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scp2P32020 547 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Senp1P59110 640 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItgaeQ60677 1167 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3d21Q7TSG5 549 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5622Q810Q0 167 aa17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Diaph2O70566 1098 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ephb4P54761 987 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acad11Q80XL6 779 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P2ry10Q8BFU7 328 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xpo6Q924Z6 1125 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbed3Q9D0L1 228 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Drap1Q9D6N5 205 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx1Q9WV80 522 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r9aH3BJD6 1292 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eno1P17182 434 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 E2f5Q61502 335 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp2b4Q6Q477 1205 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TbataQ7TSD4 393 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Daam2Q80U19 1115 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AarsQ8BGQ7 968 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpidrQ8BGX7 933 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcaf8Q8N7N5 591 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Senp2Q91ZX6 588 aa17.36■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 InhbeO08717 350 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klc1O88447 541 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gna14P30677 355 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GalcP54818 684 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abl2Q4JIM5 1182 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim37Q6PCX9 961 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyth1Q9QX11 398 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gspt2Q149F3 632 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttf2Q5NC05 1138 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phtf1Q9QZ09 761 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sclt1G5E861 688 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cracr2aQ3UP38 310 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Riox2Q8CD15 465 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Appl2Q8K3G9 662 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tom1l1Q923U0 474 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap57Q9D180 1249 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa17.35■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il13ra2O88786 383 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp26b1Q811W2 512 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scfd2Q8BTY8 684 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trex1Q91XB0 314 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tlr9Q9EQU3 1032 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tfr2Q9JKX3 798 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5814J3QP80 125 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scnn1aQ61180 699 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptger2Q62053 362 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb7bQ64321 544 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Depdc1bQ8BH88 529 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btbd7Q8CFE5 1130 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrfap1Q9CQL7 125 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep85lA0A1W2P884 806 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14525B1AZA0 212 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm2012B1B0R1 212 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esr2O08537 530 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OatP29758 439 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14819Q62478 212 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ago4Q8CJF8 861 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpap2Q8VC34 614 aa17.34■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clrn2B2RVW2 232 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10110D3Z5M2 615 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rasal2E9PW37 1286 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema6bO54951 886 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tagap1P0CAX8 505 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Flt3Q00342 1000 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YdjcQ14BV6 310 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mier3Q3UHF3 551 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tab3Q571K4 716 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adad1Q5SUE7 619 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgfr1opQ66JX5 399 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt77Q6IFZ6 572 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SpopQ6ZWS8 374 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo10Q7TQF2 950 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Srrm3Q80WV7 648 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tor4aQ8BH02 426 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo28Q8BIG4 368 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr180Q8BPS4 441 aa17.33■□□□□ 0.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms