RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZNF570Q96NI8 536 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.26■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 FLOT1O75955 427 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 UBOX5O94941 541 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 H2AFZP0C0S5 128 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 TNNI2P48788 182 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PMS2P54278 862 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SLC8A3P57103 927 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 H2AFVQ71UI9 128 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RAB34Q9BZG1 259 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 BTAF1O14981 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 A8MUI8 341 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PRKCIP41743 596 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PLTPP55058 493 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PTENP60484 403 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 GRIK5Q16478 980 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 UBE2SQ16763 222 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NEK9Q8TD19 979 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SNX24Q9Y343 169 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SBF2Q86WG5 1849 aa22.25■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RPTORQ8N122 1335 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NHSQ6T4R5 1651 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SLCO1A2P46721 670 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NCALDP61601 193 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DR1Q01658 176 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RIPK1Q13546 671 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SLC29A2Q14542 456 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SLC51AQ86UW1 340 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 PGM2Q96G03 612 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SIX2Q9NPC8 291 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 USP17L5A8MUK1 530 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RARAP10276 462 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 ITPK1Q13572 414 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DENND2CQ68D51 928 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ESYT2A0FGR8 921 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 POTEB3A0JP26 581 aa22.23■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 POTEBQ6S5H4 581 aa22.23■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 GPBP1Q86WP2 473 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CCDC38Q502W7 563 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 RAB17Q9H0T7 212 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.23■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 AMFRQ9UKV5 643 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 TRPC6Q9Y210 931 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.22■■□□□ 1.15
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PMS1-222ENST00000639501 CYP11B2P19099 503 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 ADCY7P51828 1080 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SEPT2Q15019 361 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 EPHA7Q15375 998 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 JAMLQ86YT9 394 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 CEP95Q96GE4 821 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-222ENST00000639501 EYA3Q99504 573 aa22.22■■□□□ 1.15
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