RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MGEA5O60502 916 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR2P61160 394 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 COASYQ13057 564 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 POF1BQ8WVV4 589 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 NFASCO94856 1347 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC730098B7Z3J9 87 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BQV1 296 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG7O95352 703 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ARP10275 920 aa27.25■■□□□ 1.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 EDAQ92838 391 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFV1P49821 464 aa27.24■■□□□ 1.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC6Q9Y210 931 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa27.23■■□□□ 1.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 PAK2Q13177 524 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 MTHFD1LQ6UB35 978 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 PGBD1Q96JS3 809 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-5Q9HDB9 667 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNE2O96020 404 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 STAT5BP51692 787 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 FUT2Q10981 343 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ATL3Q6DD88 541 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 VN1R2Q8NFZ6 395 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf76Q96K31 380 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD14AQ96MC6 490 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 AZI2Q9H6S1 392 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 HCSTQ9UBK5 93 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 STAG3L1P0CL83 205 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS33Q8NF86 280 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 PHOX2BQ99453 314 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.21■■□□□ 1.95
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CAPNS1-216ENST00000628306 IER5LQ5T953 404 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 MCTP1Q6DN14 999 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 NME8Q8N427 588 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP8B4Q8TF62 1192 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-216ENST00000628306 M0QZ92 97 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 MEIS1O00470 390 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RESTQ13127 1097 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP55Q53EZ4 464 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM67Q6ZTA4 783 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRC1P26715 233 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SUSD6Q92537 303 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R3CQ969Q6 453 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SDF4Q9BRK5 362 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO3Q9BYT9 981 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 LMBRD1Q9NUN5 540 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM221A6NGB7 291 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 C9IYK1 514 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R296 226 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP4AP20648 1035 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP54Q96N23 3096 aa27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-216ENST00000628306 FSCN2O14926 492 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PER2O15055 1255 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 DTNBO60941 627 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIA3O75145 1194 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVFC1P60507 584 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ZXDAP98168 799 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
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