RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFAIP2Q03169 654 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC63Q05C16 580 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 MTERF2Q49AM1 385 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 ODR4Q5SWX8 454 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM178BQ8IXR5 827 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF507Q8TCN5 953 aa27.51■■■□□ 2
CAPNS1-215ENST00000628018 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.51■■■□□ 2
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 KIF22Q14807 665 aa27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIB2Q92519 343 aa27.46■■□□□ 1.99
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa27.46■■□□□ 1.99
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CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDXKO00764 312 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 HBP1O60381 514 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 MAFO75444 373 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 EDRF1Q3B7T1 1238 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.44■■□□□ 1.98
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