RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568		M0R2N6	131 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF862	O60290	1169 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CYP3A7	P24462	503 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	GJA10	Q969M2	543 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ADAM2	Q99965	735 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	STK36	Q9NRP7	1315 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PSMD10	O75832	226 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	NPY5R	Q15761	445 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		28.9	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	GRM6	O15303	877 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	MGEA5	O60502	916 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	GPR32	O75388	356 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	UGCG	Q16739	394 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	INF2	Q27J81	1249 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	P2RX5	Q93086	422 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	RGS18	Q9NS28	235 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PFKFB2	O60825	505 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	MMP1	P03956	469 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	LETM2	Q2VYF4	491 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	MBOAT7	Q96N66	472 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NCK2	O43639	380 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	GATM	P50440	423 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	WASF1	Q92558	559 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568		C9IYK1	514 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	CSPG5	O95196	566 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	AK2	P54819	239 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	XKR3	Q5GH77	459 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	CLDND1	Q9NY35	253 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NEK8	Q86SG6	692 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NEK9	Q8TD19	979 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	SLC37A4	O43826	429 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	MTERF2	Q49AM1	385 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	AAAS	Q9NRG9	546 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	FAM50B	Q9Y247	325 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TCF4-259	ENST00000627568	ITGB1	P05556	798 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	GPC3	P51654	580 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	COL19A1	Q14993	1142 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	FAM20A	Q96MK3	541 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	DNM2	P50570	870 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	PSMC5	P62195	406 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	DSC3	Q14574	896 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	HOXA2	O43364	376 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	MARCH6	O60337	910 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TCF4-259	ENST00000627568	IL9	P15248	144 aa		28.8	■■■□□ 2.2

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