RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CHMP2AO43633 222 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GFPT2O94808 682 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PDCLQ13371 301 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SLC15A2Q16348 729 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AKT1S1Q96B36 256 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 F8VZ95 297 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MMP10P09238 476 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CCT5P48643 541 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CD302Q8IX05 232 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ACER1Q8TDN7 264 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PSME4Q14997 1843 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 EVI5O60447 810 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MCTP2Q6DN12 878 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SLC5A5Q92911 643 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CEP104O60308 925 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FLT3P36888 993 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ATP1A2P50993 1020 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PPP2R5CQ13362 524 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PALB2Q86YC2 1186 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TPH2Q8IWU9 490 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ISCUQ9H1K1 167 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 H0YGN5 161 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NFIL3Q16649 462 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MSL1Q68DK7 614 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NFS1Q9Y697 457 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FLOT1O75955 427 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM49P0CI25 452 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM49CP0CI26 452 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PDE6BP35913 854 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF131P52739 623 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GALCP54803 685 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TNNC1P63316 161 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP58Q5T655 872 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MYCT1Q8N699 235 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 HES6Q96HZ4 224 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PBKQ96KB5 322 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DMAC2Q9NW81 257 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NR2E1Q9Y466 385 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NCANO14594 1321 aa14.56□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CLSTN1O94985 981 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GAP43P17677 238 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FMO5P49326 533 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 AOC3Q16853 763 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 WHAMMQ8TF30 809 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LRRN2O75325 713 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ANXA13P27216 316 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF76P36508 570 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DAW1Q8N136 415 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 TAF4BQ92750 862 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 RUFY1Q96T51 708 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PLAAQ9Y263 795 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.55□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 YDJCA8MPS7 323 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CFBP00751 764 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 H2AFZP0C0S5 128 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 SOX5P35711 763 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms