RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 THNSL1Q8IYQ7 743 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SUSD6Q92537 303 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CWH43Q9H720 699 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ESYT2A0FGR8 921 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM221A6NGB7 291 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R296 226 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FSCN2O14926 492 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 VTNP04004 478 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFR1P11362 822 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LAG3P18627 525 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVFC1P60507 584 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM189BP81408 668 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZXDAP98168 799 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM10P98175 930 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 DSC3Q14574 896 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 RASEFQ8IZ41 740 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL13Q8N6R0 699 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LZTS1Q9Y250 596 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTS3O15072 1205 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCB3Q01970 1234 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNC3Q14003 757 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT32Q14532 448 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 USP34Q70CQ2 3546 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEB2O15479 319 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXA2O43364 376 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PSAPP07602 524 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCN3P51790 818 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PKN1Q16512 942 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 MCTP2Q6DN12 878 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC55Q6ZSA7 311 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS33Q8NF86 280 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM167AQ96KS9 214 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CASD1Q96PB1 797 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF25Q9BQ70 676 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf50Q9HD87 102 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF19AQ9NV58 838 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 AKT3Q9Y243 479 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 NID2Q14112 1375 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TMOD1P28289 359 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 GNA11P29992 359 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 CIITAP33076 1130 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1AP35813 382 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TECP42680 631 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 APOBRQ0VD83 1088 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR16Q569H4 304 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 IER5LQ5T953 404 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms