RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA33Q96N06 139 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 MED15Q96RN5 788 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS2P41220 211 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DNM2P50570 870 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP2K5Q13163 448 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NR1I3Q14994 352 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 KRT31Q15323 416 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC41Q15345 812 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 UGCGQ16739 394 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf99Q6UX52 265 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GLG1Q92896 1179 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MAML3Q96JK9 1138 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.95■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC37A2A6NM11 1700 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 COBLO75128 1261 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LY6KQ17RY6 165 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TINF2Q9BSI4 451 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 EMSYQ7Z589 1322 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ESPNB1AK53 854 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB39O15060 712 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH10BP0C881 870 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MYBPC2Q14324 1141 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NFIL3Q16649 462 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR20Q99678 358 aa24.92■■□□□ 1.58
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CAPNS1-212ENST00000591041 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 LGR5O75473 907 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FCGRTP55899 365 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAM9Q13443 819 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF22Q14807 665 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MAN2A1Q16706 1144 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MORN1Q5T089 497 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TCP11Q8WWU5 503 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP58Q9BVL2 599 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQC6 194 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF862O60290 1169 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MYBP10242 640 aa24.9■■□□□ 1.58
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