RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, human

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-215	ENST00000589536	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	ODR4	Q5SWX8	454 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	P2RX5	Q93086	422 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	ADAM2	Q99965	735 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	RGS18	Q9NS28	235 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	MYO7A	Q13402	2215 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	DENND3	A2RUS2	1198 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536		C9IYK1	514 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	CAMK1	Q14012	370 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	STK36	Q9NRP7	1315 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	CDKL5	O76039	1030 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	DSC3	Q14574	896 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	MAP7D2	Q96T17	732 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	AKT3	Q9Y243	479 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GRN-215	ENST00000589536	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	PFKFB2	O60825	505 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ITGB1	P05556	798 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	IL9	P15248	144 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TMOD1	P28289	359 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ANAPC15	P60006	121 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CD320	Q9NPF0	282 aa		27.57	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	DNAJB1	P25685	340 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	FAM189B	P81408	668 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	HYAL1	Q12794	435 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	INF2	Q27J81	1249 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	NCK2	O43639	380 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	SLC37A4	O43826	429 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	STBD1	O95210	358 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	LTBR	P36941	435 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CLDND1	Q9NY35	253 aa		27.55	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CSPG5	O95196	566 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CTDNEP1	O95476	244 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	GPC3	P51654	580 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		27.54	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	DTNB	O60941	627 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	LETM2	Q2VYF4	491 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	XKR3	Q5GH77	459 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	TMEM150B	A6NC51	233 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	COL9A1	P20849	921 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	AK2	P54819	239 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	DRP2	Q13474	957 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		27.52	■■■□□ 2
GRN-215	ENST00000589536	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GRN-215	ENST00000589536	FGFR1	P11362	822 aa		27.51	■■□□□ 1.99
GRN-215	ENST00000589536	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
GRN-215	ENST00000589536	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	27.51	■■□□□ 1.99
GRN-215	ENST00000589536	IRS1	P35568	1242 aa		27.51	■■□□□ 1.99

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms