RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587303.5

PTPRS-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 6,353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-204ENST00000587303 AP3B2Q13367 1082 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MAFGO15525 162 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ADRA2BP18089 450 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 RBL2Q08999 1139 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 SMIM5Q71RC9 77 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 NCLNQ969V3 563 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ASB14A6NK59 587 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 HIPK4Q8NE63 616 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 OSBP2Q969R2 916 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 ZBTB5O15062 677 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 SNX2O60749 519 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CEP170Q5SW79 1584 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MICALL2Q8IY33 904 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 EXOC4Q96A65 974 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 SPON2Q9BUD6 331 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MOCS3O95396 460 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CPVLQ9H3G5 476 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 TTI1O43156 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 PFDN1O60925 122 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 TRIM4Q9C037 500 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L15C9J2P7 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L11C9JVI0 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L18D6R9N7 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L22D6RA61 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L19D6RCP7 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L20D6RJB6 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 STAT3P40763 770 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 IL9RQ01113 521 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 USP17L24Q0WX57 530 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 SLMAPQ14BN4 828 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 KIF19Q2TAC6 998 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 HLA-DPA1P20036 260 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 C2orf54Q08AI8 447 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 SLC39A14Q15043 492 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MAP4K1Q92918 833 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-204ENST00000587303 MT-ND3P03897 115 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PRDX5P30044 214 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 VPS39Q96JC1 886 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 ADORA2BP29275 332 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 HMGCS2P54868 508 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 COG4Q9H9E3 785 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 SP110Q9HB58 689 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 KDM5CP41229 1560 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 BBS9Q3SYG4 887 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PASD1Q8IV76 773 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 FAF2Q96CS3 445 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 ACAP3Q96P50 834 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 SLC16A4O15374 487 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 IFNA8P32881 189 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 COPB2P35606 906 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 NME3Q13232 169 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 HSPA6P17066 643 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 PLTPP55058 493 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 KRT76Q01546 638 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-204ENST00000587303 RAD51Q06609 339 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms