RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FGD4Q96M96 766 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 K7ERI5 159 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CYTH2Q99418 400 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM94Q12767 1356 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8B3O60423 1300 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF4Q8WV16 495 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NCK2O43639 380 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA4LO95757 839 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ARL4CP56559 192 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GPC5P78333 572 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 COASYQ13057 564 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PIGBQ92521 554 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 COPEO14579 308 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RFX1P22670 979 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KRT82Q9NSB4 513 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RASA4BC9J798 803 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RASA4O43374 803 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MARK3P27448 753 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 LY9Q9HBG7 655 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZBBXA8MT70 800 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS15P98073 1019 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KLC2Q9H0B6 622 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE6P0CI01 402 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NRBF2Q96F24 287 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TTC1Q99614 292 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 DYDC2Q96IM9 177 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF3Q9H094 633 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 E9PMD0 336 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RAD17O75943 681 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KRT37O76014 449 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PMS2P54278 862 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ARPP19P56211 112 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KLC3Q6P597 504 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SH3GL3Q99963 347 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP4Q96MN2 994 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRM-211ENST00000580170 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB5O15062 677 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH2Q12809 1159 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 ARMCX2Q7L311 632 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 MBD5Q9P267 1494 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRM-211ENST00000580170 NMT2O60551 498 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PRELPP51888 382 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PASD1Q8IV76 773 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 JAK3P52333 1124 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SHROOM2Q13796 1616 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 PDHA1P08559 390 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 NT5C2P49902 561 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SPAG7O75391 227 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CDC27P30260 824 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 HIPK4Q8NE63 616 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 MXD3Q9BW11 206 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 SOX5P35711 763 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 GCLMP48507 274 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRM-211ENST00000580170 HLFQ16534 295 aa22.82■■□□□ 1.24
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