RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580004.1

NEK4P2-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NEK4P2, Length 1,012 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P2-201ENST00000580004 GHRP10912 638 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RPA1P27694 616 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CYP4A11Q02928 519 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TPH2Q8IWU9 490 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CEP170P1Q96L14 293 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 PBX4Q9BYU1 374 aa20.89■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 AMHP03971 560 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DNAJB2P25686 324 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 NBR1Q14596 966 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 AKT3Q9Y243 479 aa20.88■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GPR32O75388 356 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CLCN3P51790 818 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 PAK2Q13177 524 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.87■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TCTN1Q2MV58 587 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TCP11Q8WWU5 503 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TIFAQ96CG3 184 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 NACC1Q96RE7 527 aa20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TMEM150BA6NC51 233 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GPR182O15218 404 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 STX6O43752 255 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RPS6KA5O75582 802 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DGAT1O75907 488 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GJB5O95377 273 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 VTNP04004 478 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GPC3P51654 580 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 NPEPPSP55786 919 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 KIZQ2M2Z5 673 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 XKR9Q5GH70 373 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF410Q86VK4 478 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 PADI3Q9ULW8 664 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 COL4A6Q14031 1691 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TTC3P53804 2025 aa20.85■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CDH23Q9H251 3354 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ASAP2O43150 1006 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CD52P31358 61 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RARRES1P49788 294 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DEFB103AP81534 67 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 DEFB123Q8N688 67 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TOP1MTQ969P6 601 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RAD9AQ99638 391 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 MTMR6Q9Y217 621 aa20.84■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC26A4O43511 780 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 MED24O75448 989 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 RESTQ13127 1097 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 EMC2Q15006 297 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 KRT79Q5XKE5 535 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 AK8Q96MA6 479 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 OSMRQ99650 979 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 GINS2Q9Y248 185 aa20.83■□□□□ 0.93
NEK4P2-201ENST00000580004 TLL1O43897 1013 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC34A2O95436 690 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 PBX2P40425 430 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 FERMT3Q86UX7 667 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 MTRQ99707 1265 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.82■□□□□ 0.92
NEK4P2-201ENST00000580004 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms